BIOINFORMATIKA

Ova stranica je posvećena kursu Uvod u bioinformatiku na master studijama R i I smera i na master programu Industrija 4.0.

Predmetni nastavnik:

Asistent:

Završni ispit

  • praktični deo: 50 poena (prag: 50%)
  • teorijski deo: 50 poena (prag: 50%)
Teorijski deo se polaže pismeno, u posebnom terminu, nakon praktičnog dela, u dogovoru sa studentima. Teorijski deo mogu da polažu studenti koji su prethodno položili praktični deo i nisu ranije izlazili na teorijski deo. Praktični i teorijski deo se mogu a ne moraju polagati u istom roku. Položeni praktični deo važi do prvog izlaska na teorijski deo u okviru iste akademske godine.

Bonus poeni

  • praktični seminarski rad na samostalno odabranu temu (10 poena) (nije obavezan)
Da bi se ispit položio, neophodno je u zbiru imati najmanje 51 poen.

Primeri

Mejling lista

  • Mejling lista studenata ce biti sastavljena od mejl adresa sa Hipatije. Ukoliko koristite drugu adresu, pošaljite mejl predmetnom nastavniku.

Seminar Bioinformatika

  • Ukoliko želite da dobijate obaveštenja o sastancima seminara Bioinformatika, možete ostaviti mejl adresu preko ove forme.

Osnovna literatura

Materijali sa časova:

Spisak softvera potrebnog za predmet Uvod u Bioinformatiku možete pronaći ovde.

Materijali asistenta Aleksandra Veljkovića: github

Literatura

Primeri ispitnih rokova:

Materijali sa časova

Čas 1
Čas 2
Čas 3
Čas 4
Čas 5
Čas 6
  • Poređenje bioloških sekvenci
    • Manhattan Tourist problem
    • Pronalaženje najduže zajedničke podsekvence
    • Edit rastojanje
    • Needleman-Wunsch algoritam
  • Materijali sa časa
Čas 7
  • Poređenje bioloških sekvenci
    • Hirschberg algoritam
    • Smith-Waterman algoritam
    • Affine gap penalty alignment
  • Materijali sa časa
Čas 8
Čas 9
Čas 10
Čas 11
Čas 12 (samo za MATF)

Termin teorijskog dela ispita u ispitnom roku Jun2

Teorijski deo ispita u ovom ispitnom roku biće 8.7. a tačan termin će biti objavljen naknadno. Studenti zainteresovani da polažu teorijski deo u ovom roku treba da se upišu sledeću tabelu najkasnije do 6.7. u ponoć.

1.7.2024.

Rezultati praktičnog dela ispita u roku Jun2

Rezultate možete videti na sledećem linku. Za uvid u radove praktičnog dela ispita javiti se mejlom najkasnije do 02.07.2024. u 23:59
Termin za teorijski deo u ovom roku je 08.07. Tačno vreme biće objavljeno naknadno.

29.06.2024.

Prijavljivanje za praktični deo ispita u ispitnom roku Jun 2

Studenti koji žele da polažu praktični deo ispita u Junu 2 treba da se prijave na sledećem linku.

Molimo vas da se ne prijavljujete po automatizmu, već samo ako zaista planirate da izadjete na ispit. Prijava će biti moguća do 27.06.2024. u 23:59. Ukoliko se prijavite na anketi a naknadno ipak odustanete od ispita, molimo vas da nam to sto pre javite na mejl nevena.ciric@matf.bg.ac.rs.

19.06.2024.

Termin teorijskog dela ispita u ispitnom roku Jun1

Mole se studenti zainteresovani za polaganje teorijskog dela ispita u ispitnom roku jun1 da popune sledeći formular najkasnije do 10.6. u podne. Biće odabran termin sa najviše glasova o čemu će zainteresovani studenti biti obavešteni mejlom.

07.06.2024.

Rezultati praktičnog dela ispita u roku Jun1

Rezultate možete videti na sledećem linku. Uvid u radove je 10.06. u 9:30 u učionici 718.
Termin za teorijski deo u ovom roku će biti određen u dogovoru sa zainteresovanim studentima.

07.06.2024.

Prijavljivanje za praktični deo ispita u ispitnom roku Jun 1

Studenti koji žele da polažu praktični deo ispita u Junu 1 treba da se prijave na sledećem linku.

Molimo vas da se ne prijavljujete po automatizmu, već samo ako zaista planirate da izadjete na ispit. Prijava će biti moguća do 05.06.2024. u 23:59. Ukoliko se prijavite na anketi a naknadno ipak odustanete od ispita, molimo vas da nam to sto pre javite na mejl nevena.ciric@matf.bg.ac.rs.

27.05.2024.

Predavanja i vežbe sledeće nedelje

Sledeće nedelje, odnosno 16.05. neće biti predavanja i vežbi. U dogovoru sa studentima, nadoknada ovih časova vežbi biće održana 27.05. 14-16h putem Webex platforme. Podaci za Webex sastanak su:

  • Meeting link: https://matf.webex.com/matf/j.php?MTID=m8a338579706f46b1740eb9a7f617e49e
  • Meeting number: 2393 239 4168
  • Password: 6MkU6k9WZVt

11.05.2024.

Početak nastave

U prvoj nedelji nastave vežbe neće biti držane. Nastava na predavanjima krenuće regularno od prve nedelje nastave.

19.02.2024.

Početak letnjeg semestra

Dobro došli na kurs!

19.02.2024.

Rezultati praktičnog dela ispita u Julskom roku

Rezultate možete videti na sledećem linku. Za uvid u radove praktičnog dela ispita javiti se mejlom najkasnije do 28.06.2024. u 23:59.

25.06.2024.

Prijavljivanje za praktični deo ispita u Julskom ispitnom roku

Studenti koji žele da polažu praktični deo ispita Julskom roku treba da se prijave na sledećem linku.

Molimo vas da se ne prijavljujete po automatizmu, već samo ako zaista planirate da izadjete na ispit. Prijava će biti moguća do 24.06.2024. u 23:59. Ukoliko se prijavite na anketi a naknadno ipak odustanete od ispita, molimo vas da nam to sto pre javite na mejl nevena.ciric@matf.bg.ac.rs.

19.06.2024.

Rezultati praktičnog dela ispita u Junskom roku

Rezultate možete videti na sledećem linku. Za uvid u radove praktičnog dela ispita javiti se mejlom najkasnije do 08.06.2024. u 23:59.
Teorijski deo ispita biće održan 13.06.2024. na Matematičkom fakultetu. Tačno vreme biće naknadno objavljeno.

04.06.2024.

Prijavljivanje za praktični deo ispita u Junskom ispitnom roku

Studenti koji žele da polažu praktični deo ispita Junskom roku treba da se prijave na sledećem linku.

Molimo vas da se ne prijavljujete po automatizmu, već samo ako zaista planirate da izadjete na ispit. Prijava će biti moguća do 03.06.2024. u 23:59. Ukoliko se prijavite na anketi a naknadno ipak odustanete od ispita, molimo vas da nam to sto pre javite na mejl nevena.ciric@matf.bg.ac.rs.

27.05.2024.

Predavanja i vežbe sledeće nedelje

Sledeće nedelje, odnosno 17.05. neće biti predavanja i vežbi.

11.05.2024.

Početak letnjeg semestra

Dobro došli na kurs!

19.02.2024.

Matematički fakultet, Univerzitet u Beogradu
školska 2023/24. godina